内生菌

植物体内普遍存在着内生菌，由于其生活在没有外在感染症状的健康植物组织内部，因此植物内生菌的存在和作用长期以来未被发现。直到20世纪30年代，由于牲畜食了感染内生真菌的牧草，给畜牧业造成重大损失，才开始对植物内生菌有了初步认识。

内生菌一词“endophyte”最早是由德国科学家DeBarry于1886年提出。.....

1986年，Carrol将植物内生菌定义为生活在地上部分、活的植物组织内不引起明显症状的微生物。

1991年，Petrini提出植物内生菌是指生活史的一定阶段生活在活体植物组织内不引起植物明显病害的微生物。

1992年，K1eopper等认为植物内生菌是指能够定殖在植物细胞间隙或细胞内，并与寄主植物建立和谐联合关系的一类微生物，并首次提出了“植物理内生细菌”的概念，他认为能在植物体内定殖的致病菌和菌根菌不属于内生菌。

植物内生菌的种类也十分繁多，主要包括内生细菌、内生真菌和内生放线菌三大类。

内生细菌

截止2010年，在各种农作物及经济作物中发现的植物内生细菌已超过129种，分属于54个属，主要为假单胞菌属（Pseudomonas）、肠杆菌属（Enterobacter）、芽孢杆菌属（Bacillus）、土壤杆菌属（Agrobacterium）、克雷伯氏菌属（Klebsiella）、泛菌属（Pantoea）、甲基杆菌属（Methylobacterium）等。

内生真菌

植物内生真菌主要在药用植物、羊茅属植物、热带树木中研究较多，发现的内生真菌主要为子囊菌类（As comycet）及其无性型，包括核菌纲（Pyrenomyetes）、盘菌纲（Discomyetes）和腔菌纲（Loculoascomyetes）等。

内生放线菌

植物内生放线菌主要在红树林、热带多年生树木及一些药用作物中研究较多，主要为链霉菌属（Streptomyces）、链轮丝菌属（Streptoverticillum）、游动放线菌属（Antinoplanes）、诺氏卡菌属（Nocardia）、小单胞菌属（Micromono spora）。

农业生产

研究表明植物内生菌与病原菌具有相同的生态位，在植物体内相互竞争空间、营养，使病原菌得不到正常的营养供给而消亡，从而增强宿主抵御病害的能力。另外植物内生菌可以分泌抗生素、毒素等代谢物质，这些代谢物质能够诱导植物产生系统抗性（ISR）。因此，对植物施用植物内生菌产生的抗菌剂、抗虫剂，来增强植物的抗逆性，起到生物防治效果，既减少了化学农药对环境的污染，又保证了植物的产量品质。现有，对其对植物上的蛀虫进行驱避性的试验。

医学医药

研究表明植物内生菌代谢产物有抗肿瘤、抗菌，抗病毒等作用。Gary和Strobel等从欧洲红豆杉中分离到内生真菌Acremzonium sp.能产生一系列抗真菌、抗癌的肽类活性物质，其中白灰制菌素（leucinostatin）能很好地抑制人类的一些肿瘤细胞。Strobel研究小组从卫矛科著名药用植物雷公藤中分离到的内生真菌Cryposporiopsis cf.quercina，能产生一种新型环肽抗生素cryptocandin，对癣菌及白色念珠菌等人类病原真菌具有强烈抑杀作用，其MIC与临床应用的抗真菌药两性霉素B（amphotericin B）相当，具良好开发前景。Castillo等发现K.nzgriscans的一株内生链霉菌能够产生一类活性多肽Munumbicicins，这类多肽不仅具有广谱的抗菌活性，而且对有耐药性的病原菌、寄生虫有很好的抑制作用。利用植物内生菌的次生代谢物质开发新的药物将是今后医药方面的研究方向之一。

作为外源基因载体

由于内生菌在植物体内的适应性，一些研究者以内生菌为受体构建植物内生防病或杀虫工程菌，再将其引入植物体内，使植物起到与转基因防病杀虫植物相同或类似的作用，从而达到生物防治的目的。2000年Dowring等在从苹果苗中分离出内生菌Pseudomonesa fluorescens中转入抗病chiA基因，再把这种携带的chiA基因的内生菌接种到豆苗中，可以防治豆苗病原真菌Rhizoctomia solani，同时还在甘蔗内生菌中转入抗虫基因cry 1AC7基因，回接甘蔗，可以防治甘蔗钻心虫Eldana saccharina。美国CGI公司以内生细菌－木质棒形杆菌犬齿亚种（Clavibacter xyli subsp.cyndontis）为载体，将BT杀虫基因整合到染色体上构建杀虫工程细菌，这种杀虫工程菌从1988年开始已在美国4个州12个玉米杂交品种上进行大田试验，可使虫害损失率减轻26%～72%。

另外发现植物内生菌有降解环境污染物的功能，如从珠江入海口红树中分离到的内生菌，有清除工业废水中的有害物质，起到净化海水的作用。而Barac等研究表明某些内生菌能够降解甲苯，并且能使其宿主植物产生对甲苯的抗性，这就为利用微生物接种植物进行环境修复提供了可能。植物内生菌为环境污染治理注入了新的血液，但其相关研究才刚刚开始，有待于进一步深入。